衢州市第二人民医院肝胆外科在当地拥有非常高的声誉，主要承担衢州市区以及周边省、市、区疑难杂症的诊治和复杂脏器外伤的紧急救治工作。
科室常规开展胰十二指肠切除术、肝肿瘤综合治疗、半肝切除术、脾切除术、等手术及各种急腹症手术等。科室近三年开展新技术新项目12项，微创手术占比48.82%。科室配有当地一流的先进设备，如3D高清腹腔镜手术系统、超声外科吸引系统、能量平台、超声刀和电子胃、十二指肠、介入治疗、胆道镜系统等。
科室近三年获批科研项目5项，其中厅局级课题3项，区级课题2项目；结题科研项目3项，其中省部级科研项目1项，厅局级项目2项；举办国家级继续教育项目3项，省继续教育项目3项；发表SCI文章2篇，国家级核心期刊发表文章多篇。科室注重人才队伍的建设发展，自 1998年始在衢州地区率先开展了腹腔镜胆囊切除术，腹腔镜胆总管切开取石“T”管引流术，后来相继开展了腹腔镜脾、胰、肝切除术，腹腔镜胆囊癌根治术、胰十二指肠切除术等一系列国内外先进的微创外科手术。
科室建有浙大二院王伟林院长等3个名医专家工作站，浙大二院专家常态化来院开展诊疗活动，可满足当地患者的优质医疗服务需求。科室始终秉承“人民至上、生命至上”的理念，紧跟发展前沿，不懈努力、敢于创新，持续推动手术术式向微创化、精细化发展，为患者实施个体化、精准化诊疗。