衢州市第二人民医院病理科组建于1994年，是浙二-UCLA病理联合诊断衢州分中心，与浙大附属第二医院病理科紧密合作。目前占地面积近500平米，设置有标本取材室、常规技术室、诊断室、细胞室和档案室、标本存放室、冰冻切片检查、免疫组化室等。作为衢江区病理诊断中心，承担全区临床组织、细胞病理学检查工作。现科室检查量约1.8万例。目前科室工作人员6人，其中副高职称2人，中级职称2人。科室配备蔡司及OLYMPUS显微镜数台，多人共览显微镜，德国Leica全封闭自动脱水机、冰冻切片机、石蜡包埋机、石蜡切片机、全自动染色机，全自动免疫组化染色机、数字切片扫描仪等先进设备。

目前开展全身活体组织病理学检查，细胞病理学检查(包括脱落细胞学，甲状腺针吸细胞学等细胞学检查),术中快速冰冻病理检查，免疫组化及特殊染色检查，病理远程会诊等项目。